Bioorganische Synthese
Arbeitsgruppe Prof. Dr. Oliver Seitz
Oligonucleotid- und Peptidberechnungen
PNA, Peptid und PNA-Peptid-Konjugat
Massenberechnung
Zur Massenberechnung von PNA, Peptid bzw. PNA-Peptid-Konjugaten einfach
die Sequenz (durch Leerzeichen getrennt!) in das Feld eingeben, die
Modifikationen am N- und C-Terminus auswählen und auf
"Berechnen!" klicken. Zulässig sind die vier PNA Nucleobasen
(als Kleinbuchstaben!) sowie die Aminosäuren
(Einbuchstabencode als Großbuchstaben oder
Dreibuchstabencode!).
Beim Dreibuchstabencode auf richtige
Groß- Kleinschreibung achten! "gly" oder "lYs" werden nicht
erkannt!
Modifikationen in der Seitenkette sind in Klammern an das entsprechende
Monomer anzuhängen wie z.B. bei Lys(Alloc) oder Lys(Biotin).
Bekannte Modifikationen sind die Schutzgruppen Alloc, Fmoc, Boc, Bhoc,
Z, Trt, Mmt, Mtt, tBu, Bzl, die Fluorophore TO, Dansyl, IAEDANS,
Dabcyl, Dabsyl, TAMRA, NBD, EDANS und FAM sowie Biotin Weiterhin gibt
es die Möglichkeit eine Phosphoaminosäure durch "p
Tyr", "p Ser",... zu kennzeichnen sowie eine Disulfidbrücke
durch Verwendung von Cys(~) an den entsprechenden Positionen einzugeben.
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DNA-Berechnungen
Für die DNA-Berechnungen einfach die entsprechende Sequenz
(durch Leerzeichen getrennt!) in das Feld eingeben, eventuelle 3'- bzw.
5'- Modifikationen auswählen und auf "Berechnen!" klicken.
Zulässig sind hier derzeit lediglich die vier Nucleobasen A,
C, G und T. Weitere terminale Modifikationen sowie die
Möglichkeit ebenfalls interne Modifikationen wie z.B.
Fluorophore einzugeben werden demnächst ergänzt.
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